Publication
Award
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2013年11月
分子シミュレーション研究会 学術賞 多次元焼き戻し法の開発及び緩和モード解析とWHAM法の一般化による構造解析法の開発
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2013年3月
日本物理学会 物理学会若手奨励賞(領域12) 生体分子系で有効な拡張アンサンブル法及び構造解析法の開発
光武 亜代理
Original paper (2018-)
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Folding pathways of NuG2-a designed mutant of protein G-using relaxation mode analysis
Mitsutake Ayori, Takano Hiroshi
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 151(4) 2019年7月28日
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Karasawa Naoyuki, Mitsutake Ayori, Takano Hiroshi
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 150(8) 2019年2月28日
- Conformational change of a biomolecule studied by the weighted ensemble method: Use of the diffusion map method to extract reaction coordinates
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Fujisaki Hiroshi, Moritsugu Kei, Mitsutake Ayori, Suetani Hiromichi
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 149(13) 2018年10月7日
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Analysis of Structural Stability of Chignolin
Yutaka Maruyama, Ayori Mitsutake
Journal of Physical Chemistry B 122(14) 3801 - 3814 2018年4月12日
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Relaxation mode analysis for molecular dynamics simulations of proteins
Ayori Mitsutake, Hiroshi Takano
Biophysical Reviews 10(2) 375 - 389 2018年4月1日
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Tomonari Sumi, Yutaka Maruyama, Ayori Mitsutake, Kenji Mochizuki, Kenichiro Koga
JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 39(4) 202 - 216 2018年2月
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Dynamical Analysis Methods for Protein Folding Simulations
Mitsutake Ayori, Takano Hiroshi
BIOPHYSICAL JOURNAL 114(3) 45A 2018年2月
Lecture / oral presentation (2017-)
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横井 駿
「クラスA GPCRsのオレキシン2受容体の動的性質の研究」
第1回生体分子シミュレーション・モデリング研究会 2021年 3月29, 30日 オンライン開催 -
横井 駿、光武 亜代理
「分子シミュレーションを用いた、オレキシン2受容体の動的性質」
第76回日本物理学会年次大会 2021年 3月12-15日 オンライン開催
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川島聡, 高野宏, 光武 亜代理
日本物理学会2017年年次大会 2017年3月19日 日本物理学会
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緩和モード解析による200残基程度の蛋白質のマイクロ秒程度の分子シミュレーションの動的解析
光武亜代理, 竹内恒, 高野宏
日本物理学会2017年年次大会 2017年3月19日 日本物理学会
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生体分子の分子シミュレーションから反応座標をどう抜き出すか?
藤崎弘士, 末谷大道, 光武亜代理
日本物理学会2017年年次大会 2017年3月19日 日本物理学会
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唐澤直之, 光武亜代理, 高野宏
日本物理学会2017年年次大会 2017年3月19日 日本物理学会
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Improved Relaxation Mode Analysis of a Hen Egg-white Lysozyme Protein
KARASAWA NAOYUKI, MITSUTAKE AYORI, TAKANO HIROSHI
Biophysical Society 61st Annual Meeting 2017年2月14日
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Investigating Dynamics and Kinetics of Proteins by using Relaxation Mode Analysis
MITSUTAKE AYORI
The Third Korean-Polish Conference on "Protein Folding: Theoretical and Experimental Approaches", Korea 2017年2月8日 招待有り
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Slow Relaxation Dynamics of Hen Egg-White Lysozyme Extracted by Relaxation Mode Analysis
"The Third Korean-Polish Conference on "Protein Folding: Theoretical and Experimental Approaches",Korea 2017年2月6日
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Relaxation Mode Analysis for Molecular Simulations of Proteins
MITSUTAKE AYORI
JST-Bay Area Structural Biology Workshop, U.S. 2017年1月23日 招待有り
Poster presentation
Shun Yokoi, Acting Aya Mitsutake
"Study of dynamic properties of orexin 2 receptor using molecular simulation"
The 26th Annual Meeting of the Society of Protein Sciences will be held online on March 29 and 30, 2021. Junpei Koroku, Aya Mitsutake, Yutaka Maruyama, Tsune Takeuchi
"Determining the three-dimensional structure of signorin and its mutants by NMR analysis"
34th Molecular Simulation Debate December 15, 2020 OnlineDaiki Noguchi, Acting Aya Mitsutake
"Analysis of simulation data of 18-residue thioether-bound cyclic peptide group"
34th Molecular Simulation Debate December 15, 2020 OnlineShun Yokoi, Acting Aya Mitsutake
"Study of dynamic properties of orexin 2 receptor using molecular dynamics simulation"
34th Molecular Simulation Debate December 15, 2020 OnlineJunpei Koroku, Aya Mitsutake, Yutaka Maruyama, Tsune Takeuchi
"Determining the three-dimensional structure of signorin and its mutants by NMR analysis"
The 58th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan September 16, 17th, 2020 OnlineDaiki Noguchi, Acting Aya Mitsutake
"Analysis of simulation data of 18-residue thioether-bound cyclic peptide group"
The 58th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan September 16, 17th, 2020 OnlineShun Yokoi, Acting Aya Mitsutake
"Study of dynamic properties of orexin 2 receptor using molecular dynamics simulation"
The 58th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan September 16, 17th, 2020 OnlineKoroku Junpei
"Determining the three-dimensional structure of signorin and its mutants by NMR analysis"
The 20th Annual Meeting of the Japanese Society of Protein Sciences will be held online on July 15, 2020.Shun Yokoi, Acting Aya Mitsutake
"Dynamics of Orexin Receptor Using Molecular Dynamics Simulations"
The 20th Annual Meeting of the Japanese Society of Protein Sciences will be held online on July 15, 2020.
graduation research (Bachelor)
Yuta Nagao (FY2020)
"About protein structure prediction using Alphafold"Rei Matsumoto (FY2020)
"Principal component analysis of molecular simulation data of ACE2 and RBD protein complex "Naoya Yakushi (FY2020)
"Principal component analysis of molecular simulation of ACE2 protein "Junpei Koroku (2019)
"Determining the three-dimensional structure of signorin and its mutants by NMR analysis"Noritake Kinashi (2019)
"Simulation data analysis of thioether-linked cyclic peptides p5 and p8"Daiki Noguchi (2019)
"Simulation data analysis of 18-residue thioether-linked cyclic peptides p6 and p7" Shun Yokoi (2019)
"Study of dynamic properties of orexin / orexin receptor"